正常来说，同位素质谱仪是为测定自然丰度的样品同位素比值而设计的仪器，具有极高的灵敏度。一般情况下，我们不建议长期为测定标记物质而使用。如果要测定标记物质，我们建议将标记同位素的最高丰度控制在10atom%左右。
建议在测试时，更换全新的反应管，一定要与做非标记物质的反应管分开。测试样品时，按照标记丰度，依次从低到高测试。测试结束后，烘烤色谱柱过夜，烘烤离子源，烘烤针阀，烘烤分析器。再切换回做自然丰度样品时，先做空白，确保空白无污染后再进行测试。
在某些情况下，当你的测试样品丰度过高，超过仪器的量程时（出现平顶峰），可以通过更换高阻来调节。例如测定高丰度的15n的n2o气体时，接收m/z 45峰的法拉第杯放大器的高阻值可以从3x1010ω降至3x109ω，以降低信号强度；测定丰度极高的15n2时，除了降低接收m/z 29峰放大器的高阻值外，还必须相应降低m/z 30接收杯放大器的阻值，由1x1011ω降至1x109ω。具体详情还需要根据仪器型号考虑。
